PR Overview
Protocol Representation Model Team
27 March 2012
CDISC Japan PR Team
1
PRチームメンバー紹介(15名)
#
会社名
氏名
1
武田薬品工業株式会社
西本 博之(Leader)
2
株式会社日立インスファーマ
河合 陽一(Sub)
3
SCSK株式会社
赤松 啓介
4
株式会社ACRONET
秋谷 一平
5
日本イーライリリー株式会社
岩元 和正
6
バイエル薬品株式会社
内田 浩伸
7
株式会社新日本科学
佐藤 章一
8
株式会社 ベル・メディカルソリューションズ
秦野 昌弥
9
CTCラボラトリーシステムズ株式会社
友田 純一郎
10
大日本住友製薬株式会社
藤井 希代
11
田辺三菱製薬株式会社
森
12
アステラス製薬株式会社
水野 義久
13
株式会社富士通四国システムズ
溝渕 真名武
14
京都大学医学部付属病院 探索医療センター
山本 景一
15
イーピーエス株式会社
飯塚 久夫(J3C)
謙太郎
2
CDISC WS PR Agenda
1.PRチーム活動状況
2.PRM(Protocol Representation Model)に
ついて
3.SDM(Study Design Model) について
4.Machine Readableな組入基準による臨
床試験被験者リクルートメント予測の試み
3
PRM/SDMとは?
異なるシステム、文書の間で、試験デザインなどのプロ
トコル情報を電子的に交換するための標準
Eligibility:
Inclusion/
Exclusion
Clinical
Trial
Management
System
Trial
Design
Protocol
Document
PRM
/SDM
Clinical
Trial
Registry
EDC, CDMS
Statistical
Analysis
Plan
4
1. PRチーム活動状況
PRM:
コンセプトモデルとしてのPRモデルの概要を理解し、
現在は、PRMの各エレメントの定義を翻訳し資料としてまとめている。
SDM: PRMの実装モデルの一つとして、SDMがリリースされた。
”CDISC Study Design Model in XML (SDM-XML)” の翻訳を行い、
SDMの理解を深めている。同時に、XMLに関して勉強中。
PRMとSDMの関係
コンセプトモデル
Study Designに関
する実装モデル
表現方法
策定団体
PRM
SDTM:TDM
テーブル定義
CDISC
SDM
XMLスキーマ
CDISC
HL7 Study Design
message
XMLスキーマ
HL7(開発中)
5
コンセプトモデル と 実装モデル
モデル
表現方法
モデル名
HL7 RIM
CDISC BRIDG (PRM)
CDISC CDASH
テーブル定義 CDISC SDTM (TDM)
(構造定義) CDISC ADaM
CDISC LAB
コンセプトモデ
UML
ル(DAM)
実装モデル
HL7 XMLスキーマ
CDISC ODM
XMLスキーマ
CDISC define.xml
CDISC SDM (ODM拡張)
6
1.PRチーム活動状況
2.PRM(Protocol Representation Model)に
ついて
3.SDM(Study Design Model) について
4.Machine Readableな組入基準による臨
床試験被験者リクルートメント予測の試み
7
7
PRMとは?
300以上のプロトコルの要素(エレメント)を、BRIDGモデルにマッピングしたもの
Statistical
Analysis
cd Comprehensiv e Logical Model
Protocol Document
Name:
Author:
Version:
Created:
Updated:
Documentation
And authoring
Comprehensive Logical Model
Fridsma
1.0
8/13/2001 12:00:00 AM
4/8/2005 5:17:31 PM
Protocol::StudyBackground (the "w hy")
description: PSMDescription
summaryOfPreviousFindings: PSMDescription
summaryOfRisksAndBenefits: PSMDescription
justificationOfObjectives: PSMDescription
justificationOfApproach: PSMDescription
populationDescription: PSMDescription
rationaleForEndpoints: PSMDescription
rationaleForDesign: PSMDescription
rationaleForMasking: PSMDescription
rationaleForControl: PSMDescription
rationaleForAnalysisApproach: PSMDescription
Attribute1:
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
Protocol::
SupplementalMaterial
Protocol::
ProtocolRev iew
*
+
+
+
+
date:
result:
+
+
type:
description: PSMDescription
version:
ID: SET PSMID
1..*
Protocol::
ClinicalDev elopmentPlan
-Protocol 0..* 1
-ConceptProposal
Internal
Tracking
Protocol::
IntegratedDev elopmentPlan
*
Protocol::StudyObligation
+
+
+
+
*
1
+
+
shortTitle: TEXT
statementOfPurpose: TEXT
Protocol::Masking
type: ENUMERATED
description: PSMDescription
commissioningParty:
responsibleParty:
+
+
+
+
-?????
Protocol::
Amendment
Protocol::
CommunicationRecord
Statistical Analysis
*
1
Protocol::StudyProtocol
-_DevelopmentPlan
1
0..*
1
*
*
Protocol::StudyPlan (the "how ",
"w here", "w hen", "w ho")
*
1..*
1 +
1..*
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
version:
author: SET
ID: SET PSMID
documentID:
type: ENUMERATED = formal plus non...
description: PSMDescription
title:
status: PSMStatus
confidentialityCode: PSMCodedConcept
businessProcessMode: PSMBusinessProcessMode
1
-source
objective
*
Protocol::
StudyAssignment
+source 1
+
+
+
+
+
+target
0..*
type:
+
+
+
+
1
+primaryStudy 1
Protocol::Scope
code:
description: TEXT
type: ENUMERATED = primary, secondary
threshold:
Protocol::Concurrency
Protocol::Randomization
1..*
1
+
+
minimumBlockSize:
maximumBlockSize:
Protocol::Measure
*
Protocol::StudyObj ectiv eRelationship
type: PSMCodedConcept
+
0..1
Activity
Roles
Entities
startDate:
endDate:
studyID: SET PSMID
name:
type:
subtype:
status:
randomizedIndicator:
otherStudyCharacteristics:
description: PSMDescription
functionalRole:
effectiveStartDate:
effectiveEndDate:
authorizingID:
Entities and Roles::
Study
Protocol::AnalysisTask
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
-
Entities and Roles::Organization
+
+
+
instantiationType: ENUM {Placeholder, Actual}
id: SET <PSMID>
1
name: string
code: PSMCodedConcept
quantity: int
description: PSMDescription
statusCode: PSMStatus
1
existenceTime: PSMInterval
riskCode: PSMCodedConcept
handlingCode: PSMCodedConcept
contactInformation: SET <PSMContactAddr>
* +
+
+
+
+
+
+
+
+
geographicAddress:
electronicCommAddr:
standardIndustryClassCode:
1
1
birthTime:
sex:
deceasedInd: boolean
deceasedTime:
multipleBirthInd: boolean
multipleBirthOrderNumber: int
organDonorInd: boolean
+
Entities and Roles::
ManufacturedMaterial
-
ProtocolStructure::
ElectronicSystem
lotNumberText: string
expirationTime:
stabilityTime:
Entities and Roles::Person
Entities and Roles::
NonPersonLiv ingEntity
+
-
strain:
genderStatusCode:
Entities and Roles::Dev ice
-
+
Co-Investigator
Principal Investigator
Study Coordinator
Project Coordinator
Data Manager
Regulatory Coordinator
Patient
Pharmaceutical Liaison
Pharmacologist
Population Member
Laboratory Director
Laboratory Technologist
Technical Document Coordinator
Clinical Coordinator
Statistician
Employee
Adverse Event Coordinator
Shipping Designee
Drug Company Contact
HealthCare Provider
Physician
Research Nurse
Community Educator
Social Worker
Subject Recruiter
Research Clinician
Immunologist
Virologist
Pharmacist
Pharmacy Consignee
Pharmacy Technician
Pharmacy Director
Registration Coordinator
Clinical Trial Specialist
Monitor
Auditor
Trainer
Project Manager
Epidemiologist
manufacturerModelName:
softwareName:
localRemoteControlStateCode:
alertLevelCode:
lastCalibrationTime:
-target
analysis
-source
task
analysis
*
1
Entities and Roles::Patient
Study Design and Data
Collection::
SubstanceAdministration
confidentialityCode:
Entities and Roles::
Access
Study Design
and Data
Collection::
Procedure
Organization Roles:
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
Protocol::HypothesisTest
Protocol::
SponsorStudyManagementProj ectPlan
0..1
1
1..*
+
+
+
+
+StartEvent 1
Eligibility
Determination
+passedTo
+contains 1
Protocol::AnalysisVariableCollection
+
+
+
+
Study Design
and Data
Collection::
Observ ation
Study Design
and Data
Collection::
DiagnosticImage
+
modeValue: ENUM {Plan, Execute}
+
+
+
+
1
Study Design and Data
Collection::StudyDesign
description: PSMDescription
Study Design and Data
Collection::
StudyDesignElement
+
sequenceNumber: INTEGER
1..*
Study Design and Data
Collection::
StudyDesignArmSegment
1
+
Study Design and Data Collection::
PSMDeriv ationExpression
Protocol::PSMInterv al
startTime: timestamp
endTime: timestamp
Protocol Design - State-based
+generates 0..*
1
Problem Space Data Types
+
Study
Design
+sourceActivity
+
For example, a "principal investigator" could be
defined as a responsibility partition and the
activities and processes for which the PI is
responsible for will be collected within the PI
responsibility partition. A responsibility partition
is similar to a ActivityRoleRelationship in that it
associates activities with a role, except that
each instance of an activity existing in one and
only one responsibility partition.
type: ENUM{transformation, selection}
rule: TEXT
id: PSMID
name: TEXT
AnalysisVariable: SET[PSMAnalysisVariable]
id: PSMID
description: PSMDescription
type: ENUM{Determined,Undetermined}
value: ANY
ProtocolStructure::
Activ ityDeriv edData
ProtocolStructure::
ResponsibilityPartition
description: PSMDescription
modelAlgorithm: Algorithm
id: PSMID
assumption: SET[TEXT]
+FirstActivity 1..*
Protocol Design
1
+sourceActivity
significanceLevel:
rejectionRegion:
testStatistic:
comparisonType: ENUM{Superiority,Equivalence,Non-Inferiority}
Protocol::StatisticalModel
+EndEvent 1
0..*
+targetActivity
+
+
+
+
Protocol::
StatisticalAnalysisPlan
Protocol::
SiteStudyManagementProj ectPlan
*
+TerminatingActivity 1..*
Protocol Design -- activity-based
Protocol::PSMBusinessProcessMode
*
1..*
1
Study Design
and Data
Collection::
Subj ectEncounter
1..*
name:
description:
scheduled(Y/N):
planned(Y/N):
*
+target activity
name: TEXT
description: PSMDescription
businessProcessMode: PSMBusinessProcessMode
id: PSMID
code: PSMCodedConcept
negationIndicator: BOOLEAN
derivationExpression: TEXT
status: PSMCodedConcept
effectiveTime: GeneralTimingSpecification
activityTime: GeneralTimingSpecification
availabilityTime: TimingSpecification
priorityCode: PSMCodedConcept
confidentialityCode: PSMCodedConcept
repeatNumber: rangeOfIntegers
interruptibleIndicator: BOOLEAN
uncertaintyCode: CodedConcept
reasonCode: PSMCodedConcept
+IsContainedIn
+
+
+
+
task
+
Research Network
Research Center
University
HealthCare Facility
Correctional Institute
Laboratory
Pharmacy Distribution Center
Specimen Repository
Drug Company
Regulatory Body
Clinical Resource Contractor
CRO
Patient Advocacy Group
Insurance Agency
Study Design and Data
Collection::
Subj ectDataEv entDefinition-???
1
Protocol::
SiteSubj ectManagementProj ectPlan
Study Design and Data Collection::Activity
+
clinicalJustification: TEXT
Activity Plans
Protocol::ActivityManagementPlan
*
-source
activity
1..*
-source
activity
jobCode: PSMCodedConcept
Protocol::
SampleSizeCalculation
+
1
*
Entities and Roles::Employee
Person Roles:
formCode:
relationshipCode: PSMCodedConcept
sequenceNumber: NUMBER
priorityNumber: NUMBER
pauseCriterion:
checkpointCode:
splitCode:
joinCode:
negationIndicator: BOOLEAN
conjunctionCode:
+
+
+
+
+
+
+
+
+
relationshipCode: PSMCodedConcept
sequenceNumber: NUMBER
negationIndicator: BOOLEAN
time: TimingSpecification
contactMediumCode: PSMCodedConcept
targetRoleAwarenessCode: PSMCodedConcept
signatureCode: PSMCodedConcept
signature: PSMDescription
slotReservationIndicator: BOOLEAN
substitionConditionCode: PSMCodedConcept
id: PSMID
status: PSMCodedConcept
*
Entities and
Roles::Material
Entities and Roles::Liv ingEntity
geographicAddress:
maritalStatusCode:
educationLevelCode:
raceCode:
disabilityCode:
livingArrangementCdoe:
electronicCommAddr:
religiousAffiliationCode:
ethnicGroupCode:
+
+
+
+
+
* +
+
+
+
+
+
+
Material/Devices Roles:
+
+
+
+
-
+
+
+
+
Entities and Roles::Activ ityRoleRelationship
id:
code: PSMCodedConcept
name:
status:
effectiveStartDate:
effectiveEndDate:
geographicAddress:
electronicCommAddr:
certificate/licenseText:
Specimen
Regulated Product
Study Design and Data Collection::
Activ ityRelationship
1..*
1
Entities and Roles::Role
inputAnalysisVariables: AnalysisVariableCollection
outputAnalysisVariables: AnalysisVariableCollection
analysisType: ENUM{inferential,estimational,descriptive}
-target
task
1..*
Entities and Roles::Entity
gpsText:
mobileInd: boolean
addr:
directionsText:
positionText:
+
-
Protocol::Bias
Protocol::Endpoint
+correlativeStudy 0..*
Entities and
Roles::
ResearchProgram
synopsis:
type: test value domain = a,d,f,g
summaryDescription:
summaryCode:
detailedMethodDescription:
detailedMethodCode:
+
+
+
+
+
+
description: PSMDescription
intentCode: SET ENUMERATED
objectiveType: ENUM{Primary,Secondary,Ancillary}
id: PSMID
1
+
+
+
+
+
+
+
+
+
+
Protocol::
Configuration
Protocol::DesignCharacteristic
description: PSMDescription
Protocol::StudyObj ectiv e (the "w hat")
Protocol::Document
Protocol::Study
Entities and Roles::Place
Protocol::
Control
level:
objectOfMasking (set):
procedureToBreak:
unmaskTriggerEvent (set):
sequenceNumber: INTEGER
Study Design and Data Collection::
StudyDesignState
1
+targetActivity
ProtocolStructure::
ProtocolControlStructure
+
+
+
+
name: TEXT
entryTransition: PSMTransition
exitTransition: SET [TRANSITION]
description: TEXT
Study Design and
Data Collection::
StudyDesignEpoch
Study Design and Data Collection::PSMTransition
Protocol::PSMID
Protocol::PSMDescription
source:
date:
value:
+
+
+
synopsis: EncapsulatedData
summaryDescription: EncapsulatedData
detailedDescription: EncapsulatedData
+
+
+
+
+
criterion: RULE
eventName: TEXT
+
+
+
+
name: TEXT
value:
controlledName: PSMCodedConcept
businessProcessMode: PSMBusinessProcessMode
ProtocolStructure::
Activ ityConnector
Orphans
-
ProtocolStructure::
DecisionPoint
ProtocolStructure:
:BranchPoint
ProtocolStructure:
:MergePoint
Rule: PSMTransition
+processes
Study Design and Data Collection::
StudyDesignArm
1
+
+
targetAccrual: INTEGER
name: TEXT
Protocol::PSMAnalysisVariable
Protocol::PSMCodedConcept
+
+
+
+
+
+
+
code: TEXT
codeSystem:
codeSystemName: TEXT
codeSystemVersion: NUMBER
displayName: TEXT
originalText: TEXT
translation: SET[PSMCodedConcept]
Protocol::
BusinessRule
+IsProcessedby
Protocol::
Variance
Protocol::
Milestone
Protocol::
Waiv er
0..*
ProtocolStructure::NotificationEv ent
-
type: ENUMERATED = Sent, Received
Protocol::
Constraint
Protocol::PSMStatus
+
+
+
effectiveEndDate:
effectiveStartDate:
statusValue:
Study Design and Data Collection::
EncounterDefinitionList--???
Protocol::PSMContactAddr
«abstraction»
+
+
+
type: PSMCodedConcept
effectiveTime: PSMInterval
usage: PSMCodedConcept
Protocol::
Resource
Protocol::
EligibilityCriterion
Protocol::
ExclusionCriterion
+
listOfDataCollectionInstruments:
THEN SourceActivityCardinality = 1, TargetActivityCardinality = 1
If ControlStructure = Transistion
If ControlStructure = DecisionPointTHEN SourceActivityCardinality = 1, TargetActivityCardinality = 2..*
OR connect to another DP, F, or J.
If ControlStructure = Fork
If ControlStructure = Join
THEN SourceActivityCardinality = 1, TargetActivityCardinality = 2..*
AND each Target Activity must be in a unique Swimlane
THEN SourceActivityCardinality = 2..*, TargetActivityCardinality = 1
Source: Doug Fridsma
8
8
Holistic Overview of the Protocol Representation Model (p.17)
PRMのドメインアナリシスモデルを
分析すると、大きくはClinical Trial, Project
Management, Commonの3種類に分類され、
対象は試験実施計画書に
限定されない。
9
1. Clinical Trial関連のエレメント
この範囲だと
理解できますが、
21. 定義:活動
25. 定義:クライテリアグループ
26. 定義:クライテリアグループの構成要素の関連
53. 計画:活動
56. 計画:クライテリアグループ
57. 計画:クライテリアグループの構成要素の関連
27. 定義:クライテリアグループのオプションの関連
58. 計画:クライテリアグループのオプションの関連
22. 定義:事務的な活動
42. 定義:試験の事務的な活動
84. スケジューリング:活動
44. 定義:被験者のマイルストーン
83. 実施:活動
30. 定義:試験ユニットの配置
82. 検体の状態
43. 定義:試験薬の搬送
69. 試験活動
39. 定義:検体の保管
68. 試験
47. 治験用新薬利用範囲拡大試験
50. 介入試験
52. 観察試験
36. 定義:手順
45. 定義:薬剤の投与
38. 定義:検体の収集
33. 定義:観察
28. 定義:適格性基準
32. 定義:選択基準
29. 定義:除外基準
31. 定義:画像解析
40. 定義:層別化基準
34. 定義:観察結果
41. 定義:層別化基準の適合結果
78. 試験の引用文献
63. 引用文献の試験結果
74. 試験の目的
75. 試験結果の評価法
70. 試験薬
46. Epoch (投与スケジュール)
20. Arm (投与群)
60. 計画:無作為化割付の配置
62. 無作為化割付登録
67. 階層グループ
10
2. Project Management関連のエレメント
21. 定義:活動
23. 定義:構成要素の関連
35. 定義:オプションの関連
24. 定義:例外措置の関連
37. 定義:反復活動要素のルール
73. 試験:法的なスポンサー
この範囲だと、少し
理解に苦しむものが、
53. 計画:活動
54. 計画:構成要素の関連
59. 計画:オプションの関連
55. 計画:例外措置の関連
61. 計画:反復活動要素のルール
84. スケジューリング:活動
76. 試験:監督機関
83. 実施:活動
80. 監督機関
12. 監督委員会
90. 試験実施医療機関:監督状況
69. 試験活動
68. 試験
71. 試験:連絡先
範囲は
どこまで
なの?
81. 公的評価
77. 試験実施計画書
8.医療従事者
4. 記載者
85. 試験:概要状況
86. 試験:エントリー状況
72.試験:調整医師
87. 試験:実施医療機関
88. 試験実施医療機関:連絡先
89. 試験実施医療機関:試験担当医師
19. 被験者
18. 試験:被験者
3. 文書(記録)
5. 文書(記録)ID
6. 文書(記録)の分類
79. 試験のリソース
65. リソース
48. 資金調達
49. 公的資金調達
51. 原材料
66. サービス
64. 登録センター
11
3. Common関連のエレメント
この範囲は、上位概念の
一般的な定義ですね、
13. Person (人)
15. Qualified Person (有資格者)
16. Registry (登録機関)
11. Organizational Contact (組織:連絡先)
10. Organization (組織)
17. Resource Provider (リソース提供会社)
1. Adverse Event (有害事象)
前スライドでは英語を省略してますが、
各クラスは、下記の言葉で、
4つのレベルに分類されています。
9. Material (原材料)
14. Product (製品)
70. Study Agent (試験薬)
7. Experimental Unit (試験の要素)
2. Activity (活動)
21. Defined Activity (定義:活動)
Defined・・・ライブラリレベル
Planned・・・試験レベルの計画
Scheduled・・・被験者レベルの計画
Performed・・・被験者レベルの実績
53. Planned Activity (計画:活動)
84. Scheduled Activity (スケジューリ
ング:活動)
83. Performed Activity (実施:活動)
12
例えば、InterventionalStudyというClassの定義です、、
<Class: 集合>
InterventionalStudy
<Attribute: 属性>
ヒトに対して実施される前臨床または臨床試験の行動計画および実行。この活動
において、各個人は、臨床計画書に基づいた「医師による特定の治療」を受ける。
被験者は、診断的・治療的・その他の介入を受ける可能性がある。介入内容は無
作為化されたり、されなかったりする。その後、各個人は追跡され、生物医学的・
健康状態の状況が評価される。
試験の治療を評価するための比較指標を表すコード化された値。
例えば、プラセボ、実薬、過去の実績、対象なし、用量比較
controlTypeCode
試験の介入をコントロールする時間的な関係を表すコード化された値。
例えば、現在、過去、前/後(被験者自信がコントロール)
controlConcurrencyTypeCode
被験者を治療群またはコントロール群に割り付ける方法を表すコード化された値。
例えば、対象外、無作為化試験、非無作為化試験。
allocationCode
被験者または医師によるバイアスがかかっていないことを保証するために試験計
画が用いた盲件化の手法を表すコード化された値。
例えば、二重盲検は医師と参加者の双方が介入がプラセボか実際の治療かわか
らなくすることを意味する。これは盲件化の種別を定義した用語の一覧から選択さ
れる。
単盲検または二重盲検の試験における個々の役割を表すコード化された値。
例えば、被験者、介護士、医師、外部評価者など。
blindingSchemaCode
blindedRoleCode
interventionGroupQuantity
acceptsHealthyVolunteersIndicator
interventionDescription
acronym
phaseCode
・・・・
群の種類を表す整数。例えば、1群の試験であれば1。
対象または類似した疾患や徴候を有していない人が試験に参加可能か否かを示
す。
介入の骨格となる事柄を表す文字列。
例えば、その詳細は投与群を区別したり(例:異なる薬剤の用量の比較)、類似す
る介入を区別したり(例:移植後の心臓の除細動の比較)する可能性がある。
例えば、使用する薬剤の剤型・用量・頻度や期間を表したりする可能性がある(50
mg/m2でIV(静脈)に28日ごとの5日目に、症状が進行または受入れがたい毒性が
現れるまで続ける)。
試験を識別するための一意ではないイニシャルまたは略称。
例えば、「女性の健康促進」に対し「WHI」
試験の承認された相を意味するコード化された値。
例えば、I、I/II, II, III, N/A。
・・・・・・・
13
PRMはドメインアナリシスモデル
SDTMと違って、PRMはドメインア
ナリシスモデルで、実装モデルでは
ないので、我々には扱いが難しいね。
次の段階として、SDMというプロトコ
ルの実装モデル(XML形式)の定義
がCDISCから紹介されましたよ。
14
1.PRチーム活動状況
2.PRM(Protocol Representation Model)に
ついて
3.SDM(Study Design Model) について
4.Machine Readableな組入基準による臨
床試験被験者リクルートメント予測の試み
15
15
Overview of SDM
• Study Design Model in XMLの略称
• 歴史
– 2011年 6月にPublic comment案
– 2011年10月 Ver 1.0リリース
• 試験デザイン情報を電子的に表現する方法
– 試験実施中・実施後の情報は含まない
– CDISC ODMを拡張する定義
• ODMをベースに「試験デザイン情報」(後述)を追加
– XMLによる表現
16
SDMの4種の試験デザイン情報
1. Summary and Inclusion/Exclusion Criteria
– 試験の要約
– 選択・除外基準
2. Structure
– 投与期・投与群・活動など
3. Workflow
– 試験の開始・終了となる活動
– 各活動が完了した後に、なされる活動
– 規定外の来院時になされる活動
4. Timing
– 各期や活動がなされる日時の許容範囲
– 活動毎の時期の関係
•
ODMになかった
定義を追加
例:活動Aが開始した後、xx日以内に活動Bを開始する
17
SDMとODMのイメージ
ODMと類似した「XML」による表現
+
=
SDM
ODM
Fruitful study design XML
ODMで表現できなかった
詳細部分を表現可能に。
試験デザインの全体像を
表現できるようになった!
18
SDMのメリット・デメリット
• メリット
– 臨床試験デザイン情報を、より詳細に記述できる。
• 規制当局・医療機関・製薬企業・CRO間での意思疎通に貢献
• SDMからコンピュータによる自動生成の可能性が拡がる
– プロトコールの情報をSDM経由でEDC等に直接ロードできる可能性
– EDCの定義情報をSDMとして出力、保存・再利用の可能性
– SDMからSDTMのdefine.xmlやTxドメインを作成できる可能性
• デメリット
– 理解するのが大変
• まずはODMを理解しないと。→既にODMを理解していれば容易?
– 記載するのが大変
• 記載できる情報量が多い = 記載するのが大変
• XMLのスキルが必要? → define.xmlやODMでも同様だが?
19
SDMで定義できる情報の具体例
種別
具体例
Summary and
対象年齢は18歳以上、65歳以下
Inclusion/Exclusion
選択基準:健康な成人男性
Criteria
Structure
スクリーニング期・治療期・追跡期で構成される。
2群:プラセボ群と実薬群の二重盲検比較試験
「同意取得」、「バイタルサイン測定」等の活動をする
Workflow
「Visit X」開始時には「xxxx検査」を実施する。
「xx℃以上の発熱」があれば、「xxxx検査」を実施する。
Timing
「同意取得」後、xx週間以内にxxxx検査を実施する。
「無作為化」された後、xx日以降、xx日以内にyyyする。
20
Structure
21
SDM Sample
22
SDTMチーム作成プロトコール
23
SDM Example: Overall
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<ODM xmlns="http://www.cdisc.org/ns/odm/v1.3" ... (略)>
<Study OID="SAMPLE_STUDY">
<GlobalVariables>
ODM
<StudyName>HTT Tablet (5 mg)</StudyName>
<StudyDescription>A randomized, Multi-centre, ...(略)</StudyDescription>
<ProtocolName>HTT-55-MA2AC</ProtocolName>
</GlobalVariables>
<MetaDataVersion ...(略)>
<Protocol>
<sdm:Summary> … </sdm:Summary>
<sdm:InclusionExclusionCriteria> …
</sdm:InclusionExclusionCriteria>
<sdm:Structure> … </sdm:Structure>
<sdm:Workflow> … </sdm:Workflow>
<sdm:Timing> … </sdm:Timing>
SDMで新た
に定義され
た部分
</Protocol>
</MetaDataVersion>
</Study>
</ODM>
24
Summary: Study Parameters 1
Short Name Term
Test product is added on to existing
ADDON
treatment
AEDICT
Adverse event dictionary
AGEMAX
Planned maximum age of subjects
AGEMIN
Planned minimum age of subjects
AGESPAN Age span
BLIND
Trial blinding scheme
COMPTRT Comparative Treatment Name
CONTROL Type of control
DIAGGRP Diagnosis group
DOSE
Test product dose per administration
DOSFRQ
Test product dosing frequency
DOSU
Test product dose units
DRUGDICT Drug dictionary
INDIC
INDICTYP
LENGTH
MHDICT
Trial indications
Trial indication type
Length of trial
Medical history dictionary
Value(s)
N
SDTMチーム作成のプ
ロトコルに記載がない
ため適当に補足
MedDRA version 15.0
70 years
18 years
18-70
DOUBLE BLIND
Placebo
PLACEBO
Patients who has hypertension
5
CDISC Terminologyか
QD
ら選択
mg
WHO Drug Dictionary Enhanced 20114Q
hypertension
TREATMENT
6 weeks
MedDRA version 15.0
25
Summary: Study Parameters 2
Short Name
Term
OBJPRIM
Trial primary objective
OBJSEC
Trial secondary objective
PHASE
PLANSUB
RANDOM
ROUTE
SEXPOP
SPONSOR
Trial phase
Planned number of subjects
Trial is randomized
Test product route of administration
Sex of participants
Sponsoring organisation
TITLE
Trial title
TRT
Reported name of test product
TYPE
Type of trial
Value(s)
To assess the efficacy and the safety of HTT
5mg against placebo in the treatment of
subjects.
To describe the PK of HTT when given orally
as continuous dosing.
2
xx
Y
Oral
BOTH
CJUG2011
A randomized, Multi-centre, double-blind,
placebo controlled 2-arm parallel-group
study of the efficacy and safety of once daily
dose therapy of HTT tablet.
HTT Tablet (5 mg)
SAFETY
EFFICACY
PHARMACOKINETICS
26
SDM Example: Study Parameters
<sdm:Summary>
<sdm:Parameter OID="PAR.AEDICT" ShortName="AEDICT" Term="Adverse event dictionary">
<sdm:Value>MedDRA version 15.0</sdm:Value>
</sdm:Parameter>
<sdm:Parameter OID="PAR.AGEMAX" ShortName="AGEMAX" Term="Planned maximum age of subjects">
<sdm:Value>70 years</sdm:Value>
</sdm:Parameter>
<sdm:Parameter OID="PAR.AGEMIN" ShortName="AGEMIN" Term="Planned minimum age of subjects">
<sdm:Value>18 years</sdm:Value>
</sdm:Parameter>
<sdm:Parameter OID="PAR.AGESPAN" ShortName="AGESPAN" Term="Age span">
<sdm:Value>18-70</sdm:Value>
</sdm:Parameter>
<sdm:Parameter OID="PAR.BLIND" ShortName="BLIND" Term="Trial blinding scheme">
<sdm:Value>DOUBLE BLIND</sdm:Value>
</sdm:Parameter>
<sdm:Parameter OID="PAR.COMPTRT" ShortName="COMPTRT" Term="Comparative Treatment Name">
<sdm:Value>Placebo</sdm:Value>
</sdm:Parameter>
<sdm:Parameter OID="PAR.CONTROL" ShortName="CONTROL" Term="Type of control">
<sdm:Value>PLACEBO</sdm:Value>
</sdm:Parameter>
:
27
InclusionExclusionCriteria
sdm:Criterion
OID
CRIT.INCL1
CRIT.INCL2
CRIT.INCL3
Criterion
Condition OID
COND.INCL1
Inclusion criterion: Subject has hypertension
Inclusion criterion: serum creatinine < 1.5 mg/dL and
total bilirubin < 1.0 mg/dL
Inclusion criterion for age
:
COND.INCL2
COND.INCL3
ConditionDef (ODM)
OID
Name
Condition that
COND.
subject has
INCL1
hypertension
Description
FormalExpression
Subject who has hypertension.
Subject fulfills the following
Condition serum
COND.
criteria at the time of screening
creatinine < 1.5 and
INCL2
visit. serum creatinine < 1.5
total bilirubin < 1.0
mg/dL. total bilirubin < 1.0
mg/dL.
COND.
Age more than 18, less than 70,
Condition for age
INCL3
both inclusive.
serum creatinine <
1.5 and total
bilirubin < 1.0
Age >= 18 and Age
Machine Readable28
<= 70
SDM Example:
Inclusion Criteria/ Exclusion Criteria
<sdm:InclusionExclusionCriteria>
- <Description>
<TranslatedText xml:lang="en">Include subjects which ...</TranslatedText>
</Description>
- <sdm:InclusionCriteria>
<sdm:Criterion ConditionOID="COND.INCL1" Name="Inclusion criterion: Subject has hypertension" OID="CRIT.INCL1" />
<sdm:Criterion ConditionOID="COND.INCL2" Name="Inclusion criterion: serum creatinine &lt;
1.5 and total bilirubin &lt; 1.0" OID="CRIT.INCL2" />
<sdm:Criterion ConditionOID="COND.INCL3" Name="Inclusion criterion for age"
OID="CRIT.INCL3" />
<sdm:Criterion ConditionOID="COND.INCL4" Name="Inclusion criterion: Subject are able to sign written informed
consent" OID="CRIT.INCL4" />
</sdm:InclusionCriteria>
- <sdm:ExclusionCriteria>
<sdm:Criterion ConditionOID="COND.EXCL1" Name="Exclusion criterion: Subject has severe angina pectoris"
OID="CRIT.EXCL1" />
<sdm:Criterion ConditionOID="COND.EXCL2" Name="Exclusion criterion: Subject has severe heart failure"
OID="CRIT.EXCL2" />
<sdm:Criterion ConditionOID="COND.EXCL3" Name="Exclusion criterion: Subject has diabetes with poor control"
OID="CRIT.EXCL3" />
:
</sdm:InclusionExclusionCriteria>
29
SDM Example: Condition Definitions
- <ConditionDef Name="Condition serum creatinine < 1.5 and total bilirubin < 1.0" OID="COND.INCL2">
- <Description>
<TranslatedText xml:lang="en">Subject fulfills the following criteria at the time of screening visit. serum
creatinine < 1.5 mg/dL. total bilirubin < 1.0 mg/dL.</TranslatedText>
</Description>
<FormalExpression Context="xpath">serum creatinine &lt; 1.5 mg/dL and
total bilirubin &lt; 1.0 mg/dL
</FormalExpression>
</ConditionDef>
<ConditionDef Name="Condition for age" OID="COND.INCL3">
- <Description>
<TranslatedText xml:lang="en">Age more than 18, less than 70, both inclusive. </TranslatedText>
</Description>
<FormalExpression Context="xpath">Age &gt;= 18 and Age &lt;= 70
</FormalExpression>
</ConditionDef>-
ConditionDefはODMの標準要素
FormalExpressionによりMachine
ReadableなConditionが書ける
30
Structure1: Overview/Epoch
Structure Overview
Screening epoch
Placebo arm
HTT arm
Screening Cell
Treatment epoch
Treatment Cell
(Blinded)
Epoches
Name
Screening
epoch
Treatment
epoch
Description
Screening
Epoch
Treatment
Epoch
Entry Criteria
Exit Criteria
Entry criterion for
Exit criterion for
treatment epoch
treatment epoch
( Entry condition for
( Exit condition for
treatment epoch )
treatment epoch )
The inclusion/exclusion
criteria for the study are
31
applied here.
Structure2: Arm/Cell
arms
Name
Description
Placebo arm
Placebo arm: a placebo is being administered
HTT arm
HTT arm: HTT Tablet (5 mg)
cells
Name
Screening
Cell
Treatment
Cell
Description
Blinded /
Unblinded
Epoch
Arm(s)
Segment(s)
Unblinded
Screening Placebo arm Screening
epoch
segment
HTT arm
Blinded
Treatment Placebo arm Treatment
epoch
segment
HTT arm
Entry
Exit
Criteria Criteria
32
Structure3: Segment
Name
Screening segment
Description
Screening
Segment
Activities
informed consent activity
patient number assignment activity
demographics data collection activity
subject characteristics data collection
activity
physical examination activity
vital signs activity
12-lead ECG activity
laboratory test activity
microbiology tests activity
SF-8th health survey activity
inclusion/exclusion criteria confirmation
activity
randomization activity
33
SDM Example: Structure
<sdm:Structure>
<sdm:Epoch Name="Screening epoch" OID="EP.SCREPOCH" OrderNumber="1">
<Description><TranslatedText xml:lang="en">Screening Epoch</TranslatedText></Description>
</sdm:Epoch>
<sdm:Epoch Name="Treatment epoch" OID="EP.TREPOCH" OrderNumber="2">
<Description><TranslatedText xml:lang=“en”>Treatment Epoch</TranslatedText></Description>
</sdm:Epoch>
<sdm:Arm Name=“Placebo arm” OID=“ARM.PLACEBO”> <Description>
<TranslatedText xml:lang=“en”>Placebo arm: a placebo is being administered</TranslatedText>
</Description> </sdm:Arm>
<sdm:Arm Name=“HTT arm” OID=“ARM.HTT”> <Description>
<TranslatedText xml:lang="en">HTT arm: HTT arm: HTT Tablet (5 mg)</TranslatedText>
</Description> </sdm:Arm>
<sdm:CellDef EpochOID="EP.SCREPOCH" Name="Screening Cell" OID="CELL.SCREEN">
<sdm:ArmAssociation Type="Unblinded">
<sdm:ArmRef ArmOID="ARM.PLACEBO" />
<sdm:ArmRef ArmOID=“ARM.HTT” />
</sdm:ArmAssociation>
<sdm:SegmentRef OrderNumber="1" SegmentOID="SCREENSEG" />
</sdm:CellDef>
:
34
SDM Example: Segment
:
<sdm:SegmentDef Name="Screening segment" OID="SCREENSEG">
<Description>
<TranslatedText xml:lang="en">Screening Segment</TranslatedText>
</Description>
<sdm:ActivityRef ActivityOID="ACT.INFORMEDCONSENT" OrderNumber="1" />
<sdm:ActivityRef ActivityOID="ACT.PATIENTNUMBERASSIGNMENT" OrderNumber="2" />
<sdm:ActivityRef ActivityOID="ACT.DEMOGRAPHICSDATACOLLECTION" OrderNumber="3" />
<sdm:ActivityRef ActivityOID="ACT.SUBJECTCHARACTERISTICSDATACOLLECTION" OrderNumber="4" />
<sdm:ActivityRef ActivityOID="ACT.PHISICALEXAMINATION" OrderNumber="5" />
<sdm:ActivityRef ActivityOID="ACT.VITALSIGNS" OrderNumber="6" />
<sdm:ActivityRef ActivityOID="ACT.12-LEADECG" OrderNumber="7" />
<sdm:ActivityRef ActivityOID="ACT.LABORATORYTEST" OrderNumber="8" />
<sdm:ActivityRef ActivityOID="ACT.MICROBIOLOGYTESTS" OrderNumber="9" />
<sdm:ActivityRef ActivityOID="ACT.SF-8THHEALTHSUVEY" OrderNumber="10" />
<sdm:ActivityRef ActivityOID="ACT.INCLUSION/EXCULUSIONCRITERIACONFIRMATION" OrderNumber="11"
/>
<sdm:ActivityRef ActivityOID="ACT.RANDOMIZATION" OrderNumber="12" />
</sdm:SegmentDef>
:
35
SDM Example: Activity
-<sdm:ActivityDef Name="informed consent activity" OID="ACT.INFORMEDCONSENT">
<sdm:ActivityDef Name="patient number assignment activity" OID="ACT.PATIENTNUMBERASSIGNMENT" />
<sdm:ActivityDef Name="demographics data collection activity" OID="ACT.DEMOGRAPHICSDATACOLLECTION" />
<sdm:ActivityDef Name="subject characteristics data collection" OID="ACT.SUBJECTCHARACTERISTICSDATACOLLECTION"
/>
<sdm:ActivityDef Name="physical examination activity" OID="ACT.PHISICALEXAMINATION" />
<sdm:ActivityDef Name="laboratory test activity" OID="ACT.LABORATORYTEST" />
<sdm:ActivityDef Name="microbiology tests activity" OID="ACT.MICROBIOLOGYTESTS" />
<sdm:ActivityDef Name="SF-8th health survey activity" OID="ACT.SF-8THHEALTHSUVEY" />
<sdm:ActivityDef Name="inclusion/exclusion criteria confirmation activity"
OID="ACT.INCLUSION/EXCULUSIONCRITERIACONFIRMATION" />
<sdm:ActivityDef Name="laboratory test activity" OID="ACT.LABORATORYTEST" />
<sdm:ActivityDef Name="concomitant medications activity" OID="ACT.CONCOMITANTMEDICATIONS" />
<sdm:ActivityDef Name="pharmacokinetics activity" OID="ACT.PHARMACOKINETICS" />
<sdm:ActivityDef Name="adverse events activity" OID="ACT.ADVERSEEVENTS" />
<sdm:ActivityDef Name="exposure to study drug activity" OID="ACT.EXPOSEURETOSTUDYDRUG" />
<sdm:ActivityDef Name="drug accountability activityCG activity" OID="ACT.DRUGACCOUNTABILITY" />
<sdm:ActivityDef Name="Compliance" OID="ACT.COMPLIANCE" />
<sdm:ActivityDef Name="randomization activity" OID="ACT.RANDOMIZATION" />
<sdm:ActivityDef Name="vital signs activity" OID="ACT.VITALSIGNS" />
<sdm:ActivityDef Name="12-lead ECG activity" OID="ACT.12-LEADECG" />
36
Study Events1
Study Events (いわゆるVISITに近いもの)は、SDMではなく、ODMの標準項目であ
る。ODMの標準項目であるStudy Eventから、SDMのActivitiesを参照する。
Name
Screening
Period
(Visit 1)
Treatment
Period
(Visit 2)
Description
Type
Repeating Activities
-14 days to
-1 day before Scheduled No
Visit 2
day1
Scheduled No
demographics data collection activity
subject characteristics data collection
activity
physical examination activity
vital signs activity
12-lead ECG activity
laboratory test activity
microbiology tests activity
SF-8th health survey activity
vital signs activity
laboratory test activity
pharmacokinetics activity
concomitant medications activity
37
Study Events2
Name
Description
Type
Repeating
Activities
compliance activity
-28 days
Treatment
(±7days)
Period
Scheduled No
after Visit 2.
(Visit 3)
At Visit 3
vital signs activity
12-lead ECG activity
Blood Sampling for laboratory tests and
Pharmacokinetics
concomitant medications activity
adverse events activity
exposure to study drug
drug accountability
38
1.PRチーム活動状況
2.PRM(Protocol Representation Model)に
ついて
3.SDM(Study Design Model) について
4.Machine Readableな組入基準による臨
床試験被験者リクルートメント予測の試み
39
39
THANK YOU!
Strength through
collaboration.
40
40
ダウンロード

SDM - CDISC Portal